上海交通大学绍兴新能源与分子工程研究院定位为绍兴市滨海新区举办，上海交大化学化工学院运营与管理的独立法人、二级事业单位，实行理事会领导下的院长负责制。研究院聚焦产业需求，持续推进三大基本任务：一是科技创新与成果转化；二是专业人才培养与培训；三是战略规划与技术咨询。在科技创新与成果转化方面：建立创新平台，开展科技创新；开展工程技术集成创新，推进科技成果孵化与转移；建立双创企业平台，助推战略新兴产业升级。在专业人才培养与培训方面：组织开展在职专业学位教育；围绕新型产业，组织开展各类技术培训；举办各类学术与技术交流活动。在战略规划与技术咨询方面：组织开展在职专业学位教育；围绕新兴产业，组织开展各类技术培训；举办各类学术与技术交流活动。